中國領(lǐng)銜全球**大植物基因測序 水稻育種由手工篩選走向精準設計

　　迄今全球**大植物基因測序項目“3000份水稻基因組研究”26日結出碩果——北京時(shí)間當天凌晨1點(diǎn)，國際****學(xué)術(shù)期刊《自然》正式發(fā)表《3010份亞洲栽培稻基因組研究》；由中國主導的此項國際間科研大協(xié)作，針對水稻起源、分類(lèi)和馴化規律進(jìn)行了深入探討，揭示了亞洲栽培稻的起源和群體基因組變異結構，剖析了水稻核心種質(zhì)資源的基因組遺傳多樣性。這一重大成果將推動(dòng)水稻規?；虬l(fā)掘和水稻復雜性狀分子改良，提升全球水稻基因組研究和分子育種水平，使水稻育種由傳統的手工篩選走向基于大數據的精準設計。

　　該項目首席科學(xué)家、中國農科院作科所研究員黎志康表示，過(guò)去和未來(lái)的育種成果都取決于我們對種質(zhì)資源遺傳多樣性的利用；全球一共保留了78萬(wàn)份水稻種質(zhì)資源，弄清核心種質(zhì)資源的基因組的多樣性，包括所有基因的等位基因及其各種各樣的變異，能夠為未來(lái)的水稻品種改良建立永久的、基于水稻功能基因組信息的數據庫和應用平臺。

　　他介紹，項目經(jīng)嚴格的分層取樣法，選取源于全球89個(gè)國家的3010份水稻種質(zhì)，代表了78萬(wàn)份中95%以上的遺傳多樣性。研究發(fā)現了

　　2900萬(wàn)份新的SNPs(單核苷酸多態(tài)性)，相當于在水稻基因組中加進(jìn)了2900萬(wàn)個(gè)標簽，給基因育種提供了精確導向；恢復了秈稻、粳稻的命名；完成了對栽培稻**精細的種群分類(lèi)：九個(gè)群體，包括4個(gè)秈稻亞群、3個(gè)粳稻亞群及Aus、Aro；發(fā)現了豐富的基因組結構變異，包括易位、倒位、重復和缺失；確定了全球首個(gè)近于完整的、高質(zhì)量的農作物-亞洲栽培稻的泛基因組。

　　國際水稻研究所首席科學(xué)家，國際水稻基因庫主任R·S·漢密爾頓博士評價(jià)說(shuō)，“過(guò)去從一個(gè)性狀發(fā)現到品種育成需要近40年，現在利用這些信息短短幾年就可以實(shí)現”。此外，該項研究還可以使育種過(guò)程更加高效和精確，使育成品種減少對環(huán)境的影響，低投入高產(chǎn)出，以及適應消費者不斷變化的需求。

　　該項研究由中國農科院作科所牽頭，聯(lián)合國際水稻研究所、華大基因、上海交大、深圳農業(yè)基因所、安徽農大、美國亞利桑那大學(xué)等16家機構共同完成，并得到中國科技部、農業(yè)農村部、國家自然基金委及美國蓋茨基金會(huì )支持。